Sostituzione massiccia di agenti patogeni multiresistenti tra uomo, animali domestici e animali selvatici

Lo scambio di agenti patogeni tra esseri umani, animali domestici e animali selvatici ha un'influenza decisiva sulla diffusione della resistenza agli antibiotici, secondo i risultati di uno studio internazionale che ha coinvolto ricercatori della Freie Universität di Berlino e del Robert Koch Institute (RKI). I ricercatori hanno pubblicato i loro risultati di studio sulla rivista "PLoS Genetics".
Gli scienziati hanno scoperto che "una variante di E. coli di produzione di ESBL multiresistente e resistente a livello globale può essere ampiamente trasmessa tra esseri umani, animali domestici e animali selvatici", secondo l'RKI. Questo è ciò che hanno rivelato le analisi dell'albero genealogico dei patogeni. Lo scambio tra le diverse specie ha quindi un'influenza significativa sulla diffusione di agenti patogeni multiresistenti.

Analisi genealogiche indispensabili per il controllo delle infezioni
Oltre ai ricercatori guidati da Alan McNally della Nottingham Trent University, Sebastian Günther e Katharina Schaufler della Libera Università di Berlino e il Presidente della RKI, Lothar H. Wieler, hanno partecipato allo studio. Utilizzando un nuovo metodo bioinformatico, i ricercatori sono stati in grado di rappresentare il pedigree del patogeno in un'alta risoluzione precedentemente ineguagliata. Tali "analisi genealogiche (analisi filogenetiche) sono indispensabili per monitorare lo sviluppo, la diffusione e la trasmissione di agenti patogeni e resistenza agli antibiotici e per migliorare la protezione contro le infezioni", riferisce il RKI.
Gli agenti patogeni circolano tra umani, animali e animali domestici
Nel presente studio, il team di ricerca internazionale ha analizzato lo scambio di cosiddetti batteri E. coli produttori di ESBL tra esseri umani, animali domestici e bestiame. Gli scienziati affermano da tempo che "i patogeni - e i tratti ereditari che rendono possibile la resistenza in primo luogo - circolano tra gli esseri umani, gli animali e l'ambiente", afferma l'RKI. Un esempio di questo è il batterio E. coli che produce ESBL multiresistente, che forma speciali enzimi batterici (il cosiddetto Extended-Spectrum Beta-Lactamases, ESBL) e quindi inattivano vari antibiotici.
Analisi del genoma nucleare e del genoma accessorio e normativo
Più di 200 isolati di una particolare variante di E. coli che produce ESBL (sequenza tipo 131; ST131), che proveniva da diversi paesi e ospiti, sono stati analizzati dai ricercatori. Per il loro studio, hanno combinato per la prima volta l'analisi dettagliata del genoma nucleare con l'analisi del genoma accessorio e normativo, riferisce l'RKI. Il genoma descrive l'insieme di tutte le informazioni ereditabili di un organismo e il genoma nucleare si verifica in tutti i rappresentanti di una specie. Inoltre, tuttavia, ci sono altri geni che possono variare, che nella loro interezza sono indicati come genoma accessorio. Inoltre, i batteri possono "controllare il loro genoma in maniera mirata" e "le aree responsabili di ciò sono chiamate il genoma regolamentare", spiega il RKI.
Guarda l'evoluzione dei patogeni
La combinazione dell'analisi di tutte e tre le regioni del genoma ha consentito agli scienziati, secondo la loro stessa affermazione, una visione con una risoluzione senza precedenti nell'evoluzione e nella distribuzione di questi patogeni. In linea di principio, "la sorveglianza molecolare, l'indagine completa sui genomi degli agenti patogeni e l'analisi dello sviluppo e della disseminazione, nel controllo delle infezioni stanno diventando sempre più importanti", ha affermato l'RKI. I batteri Gram-negativi multiresistenti (MRGN) minaccerebbero sempre più i progressi della medicina umana e veterinaria. Un prerequisito essenziale per la sorveglianza molecolare sono potenti sequenziatori e l'esperienza dei bioinformatici. (Fp)